济宁市轨道交通线网总规模达239公里，总共由5条线路构成。济宁市城市轨道交通第一轮建设规划方案由2号线一期、3号线一期和L6线一期(济宁市孔孟旅游快线)3条线路组成，线路总长度为65.5km，共设置车站37座。
（1）轨道1号线：全长67公里，串联太白湖、任城、兖州、曲阜，具体线位为济宁大道、古槐路、金宇路、崇文大道、兖州梁州路、兖州建设路、孔子大道。
（2）轨道2号线：全长48公里，串联嘉祥、经开区、任城区和高新区、石桥，具体线位为太白楼路、崇文大道、海川路。
（3）轨道3号线：全长51公里，串联太白湖区、任城区、高新区、兖州区具体线位为济宁大道、车站南路、琵琶山路、济阳线、兖州胜利路、兖州建设路，远景考虑设支线连接兖州北部与济宁新机场。
（4）轨道4号线：全长46公里，串联太白湖区、高新区以及邹城，具体线位为济宁大道、石佛路、岚济路、太平路。
（5）轨道5号线：全长27公里，串联邹城与曲阜，具体线位为104国道、峄山路。
结合济宁市城市总体规划用地布局和道路红线情况，在城市中心区内采用地下敷设方式，城市外围地区道路条件较好地段采用高架线形式。济宁市轨道交通线网全长187.70km，其中地下线72.86km，地上线114.84km，地下线比例达到39%。
首期总投资约80亿元，首期里程约35公里，最高时速80km/h。该线路已进入先期地质勘探阶段，2017年年底将建成一段示范线路，供市民乘坐体验。
济宁市城市轨道交通线网规划以协调与支持都市区发展为首要目标，提升中心城区首位度，加快济宁都市区一体化发展，逐步建立以轨道交通为骨干的公共交通出行模式，创造良好的城市环境。通过以下三个阶段，形成符合城市发展要求的线网建设时序。
起步阶段（2011年－2020年）
先期建设轨道交通1号线，形成覆盖任城区、兖州区、邹城市、曲阜市的主要客流走廊，同时加强与曲阜高铁站的联系，线网规模64.05km，设站23座。
发展阶段（2021年－2030年）
远期建设轨道交通2、3号线，结合与嘉祥和邹城的衔接，完善嘉祥－任城－邹城－曲阜的轨道交通联系，完成都市区内骨架线网的2、3号线，全长96.87km。轨道交通线网总规模达到160.92km。
完善阶段（2030年以后）
在3条骨架线网的基础上延伸扩展，促进济宁市都市区空间体系的形成，加强济宁市区与西部经开区和机场的交通联系。新增轨道交通2号线支线，全长26.78km，轨道交通线网总规模达到187.7km。
根据8月29号发布的《济宁市城市轨道交通第一轮建设规划（2019-2024）及线网规划环境影响评价第一次公示》2号一期线路西起汽车西站，沿呈祥大道向东采用高架敷设，过京杭运河大桥后，线路向东沿太白楼西路敷设至济安桥路处线路转为地下敷设，线路继续向东进入老城中心，沿太白楼东路向东敷设至洸府河，后转为高架向东敷设至同济路处，线路折向北沿同济路敷设，后转至崇文大道向东敷设，终点位于瑞园路交叉口处。2号线一期工程线路全长18.25 km，其中高架段约10.25km，地下段7.2km，过渡段0.8km。全线设车辆段一座。安居北车辆段位于汽车西站西侧，济宁交运集团物流中心西南角区域附近的地块。3号一期线路西起胡庄站，沿规划路向东高架敷设，至京杭运河西岸拐向济宁大道过京杭运河向东继续敷设，至车站南路折向北，于双拥路站后转为地下，经济宁火车站折向车站东路向东北敷设，折向琵琶山路向北敷设，后于洸府河路转为高架形式继续向北敷设，止于仁兴路站。线路全长17.8km，其中高架段约11.25km，地下段5.15 km，过渡段1.4km。全线设车辆段一座。安居南车辆段位于汽车西站东侧，G105与G327连荷线西北角第二象限区域附近的地块。L6线一期线路自北向南途径主要路由为：曲阜东站前路、曲尼路、南站规划道路、国道G104、峄山北路、峄山中路、峄山南路敷设。线路全长约29.45km，共设车站14座，线路全线采用高架敷设方式，车站均为高架车站。全线设一段一场，邹城南车辆段位于峄山南路与城前西路西南方向，临近铁路线，接轨邹城汽车南站；大埠南停车场位于日兰高速与京台高速西南角，接轨大埠南站。
